Conan Movie 22 xoay quanh nhân vật Tooru "Zero" Amuro và nghi vấn cảnh sát trưởng Kuroda là một trong những thành phần của tổ chức áo đen. "Edge of Ocean", một cơ sở mới của Vịnh Tokyo sẽ là nơi tổ chức Hội nghị Thượng đỉnh Tokyo. Hội nghị sẽ được tổ chức vào ngày 1/5 và có tới 22.000 cảnh sát được huy động, nhưng một vụ nổ bom cực lớn đột ngột xảy ra tại cơ sở siêu hoành tráng này! Tại nơi đó, vào lúc xảy ra vụ việc, lại nhìn thấy bóng dáng của Amuro Tooru thuộc tổ chức bí mật của Cảnh sát Quốc gia với bí danh là "Zero" đang điều khiển các cảnh sát an ninh trên toàn quốc. Tại hiện trường, cảnh sát đã phát hiện dấu vân tay của Mori Kogoro và ông bị bắt. Để chứng minh ông Mori vô tội, Conan đã bắt tay vào điều tra nhưng liên tục bị "kẻ 3 mặt" Amuro cản đường....

Trong lần phá án này, nhiệm vụ của Conan là bảo vệ "Viên Đá Định Mệnh" trước lời thách thức của siêu trộm Kid. Trong buổi công diễn vở kịch cuối cùng, hắn hóa thân thành Shinichi và thản nhiên tới gần Ran. Mải tập trung vào mục đích chính, Conan bị mắc bẫy khi bị hắn đánh lạc hướng. Bởi Kid sẽ thực sự hành động trên chuyến bay của cô Juri tới Hakodate... Thảm họa xảy ra trên máy bay khi một hung thủ âm mưu giết cô Juri xuất hiện. Liệu mọi người có sống sót khi cả hai phi công bị nhiễm độc, máy bay đang rơi tự do? Conan có bắt được siêu trộm Kid và giao nộp hắn cho cảnh sát hay không?...

Conan bị vướng vào rắc rối của gia đình Mori. Murakami, kẻ tội phạm đã bị Mori tống giam nhiều năm trước nay được ra tù. Vì hận thù Mori mà dường như Murakami đang lần lượt gây ra các vụ thương tích và án mạng đối với những người thân thích của ông Mori. Bi kịch thảm sát liên tiếp xảy ra, liệu phán đoán của cảnh sát về hung thủ có đang đi đúng hướng? Conan sẽ làm thế nào để ngăn chặn cuộc đua giết người và tìm ra hung thủ thực sự?...